Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms