Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO28Q9NVF7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms