Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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