Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms