Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXD4L1Q9NU39 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms