Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK0

KLC4, Kinesin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC4Q9NSK0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLC4Q9NSK0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms