Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP4Q9NRJ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms