Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
PRDM10Q9NQV6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM10Q9NQV6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms