Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
XPNPEP3Q9NQH7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms