Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMMDC1Q9NPL8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms