Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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