Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms