Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2J2Q9GZM3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms