Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LNPKQ9C0E8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms