Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX6-2Q9C056 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX6-2Q9C056 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms