Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF1Q9BZW5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms