Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDEM3Q9BZQ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDEM3Q9BZQ6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms