Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms