Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms