Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms