Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRTQ9BXP5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms