Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms