Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP58Q9BVL2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms