Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms