Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms