Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms