Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms