Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms