Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms