Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF48Q96MX3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF48Q96MX3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms