Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms