Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms