Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.9 ms