Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms