Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
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