Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASIC4Q96FT7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms