Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms