Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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