Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF4Q8WV16 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms