Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL11Q8NHH1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms