Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38AQ8NAV1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms