Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71DQ8N9W8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71DQ8N9W8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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