Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT2Q8N9I0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT2Q8N9I0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms