Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms