Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL3Q8IVW4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL3Q8IVW4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL3Q8IVW4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL3Q8IVW4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms