Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC6Q8IVU3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms