Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF554Q86TJ5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF554Q86TJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms