Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms