Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYDE1Q6ZW31 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms