Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R3FQ6ZSY5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms